新冠病毒谱系或已在蝙蝠中传播数十年

原标题：新冠病毒谱系或已在蝙蝠中传播数十年

经济日报

近日，《自然》子刊《自然微生物学》发表了一篇探讨新冠病毒起源的论文，提出新冠病毒可能在约40年至70年前就从与之关系最紧密的蝙蝠病毒中分化出来了。这一发现意味着：产生新冠病毒（SARS-CoV-2）的病毒谱系可能已经在蝙蝠中传播了数十年。

该研究由来自美国宾夕法尼亚州立大学、比利时KU鲁汶雷加研究所、英国爱丁堡大学、英国格拉斯哥大学病毒研究中心等多家研究机构共同完成。

追溯新冠病毒SARS-CoV-2的演化历史是件困难的事。因为，病毒会重组，即不同病毒之间交换遗传物质，而冠状病毒具有高度重组能力。对于冠状病毒来说，重组意味着病毒的小基因组亚区可能具有不同祖先起源。

此前，有中国科学家研究指出，新冠病毒与一种从蝙蝠中采集到的RaTG13冠状病毒关系很近，序列相似性达到96%，提示新冠病毒COVID-19的暴发可能源于蝙蝠。也有科学家在穿山甲体内发现了相似冠状病毒，由此认为穿山甲可能是新冠病毒的中间宿主。

新冠病毒是一种新的Sarbecovirus亚属的β冠状病毒。研究团队使用有关Sarbecovirus的基因组数据，分析了新冠病毒的演化历史。他们采用了3种生物信息学方法来鉴定未经历重组的，以及可用于重构病毒演化历史的SARS-CoV-2病毒区域。

所有方法均表明，RaTG13与SARS-CoV-2拥有共同的单一祖先谱系，估计SARS-CoV-2分别在1948年、1969年和1982年从相关蝙蝠病毒中分化出来。

研究人员还检查了SARS-CoV-2刺突蛋白的受体结合域（RBD），它使病毒能够利用人ACE2受体进入细胞。虽然已经表明SARS-CoV-2的刺突蛋白在遗传上更接近穿山甲病毒而非RaTG13，但研究者没有在刺突蛋白上发现证据，可表明产生SARS-CoV-2的病毒与其他已知Sarbecovirus病毒之间发生了重组。

根据这一发现，他们提出，刺突蛋白及其RBD是产生SARS-CoV-2病毒、RaTG13与穿山甲病毒的先祖特征。并得出结论：虽然SARS-CoV-2与穿山甲病毒拥有一个共同祖先，且穿山甲可能在SARS-CoV-2传人的过程中发挥了一定作用，但它们不太可能是中间宿主。

研究者认为，SARS-CoV-2分化时间长，表明可能存在未取样、具有潜在传染力的蝙蝠病毒谱系，这种传染力来源于承自祖先的SARS-CoV-2 RBD上人适应接触残基的遗传位点。不过，研究人员还需要更好地开展采样来评估这一点。

研究者总结表示，蝙蝠病毒谱系中病毒重组的现有多样性与动态过程证明了，要事先鉴定出有可能引发重大人类疫情暴发的病毒有多么困难。这突出表明，我们需要建立一个人类疾病全球实时监测系统，具备快速鉴定病原体的能力。

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